Christoph Daum anuncia una nueva era
Christoph Daum se convierte en el nuevo entrenador del Bayer 04. El traspaso de Daum del Besiktas al Leverkusen se anuncia durante la Eurocopa de Inglaterra. También hay caras nuevas en la plantilla: Jens Nowotny, Erik Meijer, Jan Heintze, Robert y Niko Kovac y René Rydlewicz son los nuevos fichajes para la temporada.
Vuelve el león
También se presenta un nuevo escudo del club. Con un diseño moderno, el nuevo escudo se basa en la tradición del león del Bayer, que guarda relación tanto con Bayer AG como con el Bergisches Land y la región de Leverkusen.
Big Mac en el BayArena
Y otro estreno: el 23 de octubre de 1996 se inaugura el restaurante McDonald's y la tienda para aficionados del Bayer 04 en la Bismarckstraße.
Feldhoff anota tres goles contra el Bayern
El equipo que estuvo a punto de descender la pasada temporada tiene un comienzo de ensueño en la Bundesliga con una victoria por 4-2 contra el vigente campeón, el Borussia Dortmund, en su primer partido. Un triunfo con un notable efecto revelador.
El Bayer sigue avanzando y se consolida en lo más alto de la tabla. Y por fin vuelve a celebrar una fiesta del fútbol en el BayArena. Como el 9 de marzo de 1997, cuando el Bayer 04 se juega el todo por el todo en una victoria por 5-2 contra el Bayern München. Markus Feldhoff juega el partido de su vida y marca tres goles.
Kirsten y Sergio: La tormenta soñada
El Bayer se hizo fuerte en casa, ganando 15 de los 17 partidos disputados como local (una derrota y un empate), y marcando goles como el 5-3 contra el Freiburg, el 5-0 contra el Hamburg o el 4-2 contra sus vecinos del Köln. Paulo Sergio y Ulf Kirsten, en particular, no dejan de marcar goles. Al final de la temporada, Kirsten se convirtió en el máximo goleador de la Bundesliga por segunda vez desde 1993, con 22 tantos. Sergio también marca 17 goles. Con 39 goles entre los dos, forman el mejor ataque de la liga.
Primer subcampeonato
Al final, el Bayern München y el Bayer terminan empatados en la lucha por el título. Con una derrota por 4-0 ante sus vecinos del otro lado del Rin, el Bayer perdió todas las opciones de ganar el título en la penúltima jornada. No obstante, en la 34ª jornada se celebró el subcampeonato y la participación en la fase previa de la UEFA Champions League.