Den Vorsitz der Geschäftsführung der Bayer 04 Leverkusen Fußball GmbH hat seit dem 1. Juli 2018 Fernando Carro inne. An der Seite des Spaniers fungiert Simon Rolfes als Geschäftsführer Sport. Die Geschäftsleitung des Fußball-Bundesligisten setzt sich aus zehn Personen zusammen. Als Vorsitzender des sechsköpfigen Gesellschafterausschusses von Bayer 04 ist Werner Wenning tätig.